Вы получаете полный доступ к серверу и можете копировать файлы, устанавливать программы по своему усмотрению.
Чтобы скопировать инсталляцию и базы 1С (а также другие файлы) на сервер нужно:
- запустить у себя на компьютере "Пуск"->"Подключение к удаленному рабочему столу"
- в окне ввода параметров подключения нажать на кнопку "Параметры" и перейти на закладку "Локальные ресурсы"
- на закладке в разделе "Локальные устройства и ресурсы" нажать кнопку "Подробнее"
- в списке дисков выбрать те, которые нужно подключить на сервер
- после этого ввести адрес виртуального сервера, логин и пароль и подключится - выбранные локальные диски появятся на сервере и с них/на них можно копировать файлы.